Шеппард проходил службу на базе МакМердо – возможно, это была черная метка в его послужном списке – ему подходила тишина и покой Антарктики. Он должен был доставить генерала Джека О’Нилла на аванпост Древних для осмотра обнаруженных технологий. Здесь он выяснил, что обладает необычным геном, который управляет Древними технологиями. И в отличие от остальных, кто имеет такой ген, Джону не составляет никакого труда им воспользоваться. Вейр уговорила О’Нилла позволить Шеппарду войти в состав команды, несмотря на то, что в Афганистане он ослушался приказа и отправился спасать двух своих сослуживцев.

По прибытию в галактику Пегас Шеппард отправился на планету Атос с заданием найти дополнительный МНТ для восстановления энергии в затонувшем городе Атлантиде. Он познакомился с атозианцами и их лидером, Тейлой Эммаган. Он узнал об опасности нападения рейфов, расы однажды уже победившей Древних, на его глазах произошел сбор, попали в плен Тейла и Самнер, его командующий офицер. Шеппард вернулся в Атлантиду с оставшимися атозианцами и организовал спасательную операцию. Операция прошла удачно, но в процессе Шеппард разбудил всю расу рейфов, убив их Хранительницу.

Джон оказался старшим офицером из всего военного контингента и стал вторым после Вейр командиром экспедиции. Год спустя его повысили до подполковника, и он официально стал главнокомандующим военного контингента Атлантиды. Когда доктор Вейр попала к репликаторам, Джон был в списке претендентов на должность руководителя городом, но к счастью, командование досталось полковнику Саманте Картер.

Шеппарду нравятся чертово колесо, футбол и «все, что движется со скоростью больше 200 миль в час». Он любит слушать Джонни Кэша, добрый и щедрый, и не боится высказывать свое мнения, если конечный результат принесет пользу его команде. Очень мало известно о его прошлой жизни, в свое время он был женат.

В ходе одной из миссий ему поручили командование крейсером BC-304 "Дедал" для осуществления разведывательной операции на окраине галактики Пегас, корабль отлетел на некоторое расстояние от планеты, но при этом вышел на одну линию с солнцем, на котором происходили многочисленные вспышки, корабль совершил гиперпрыжок, но из-за вспышек координаты в компьютере сбились и он попал в пространство между Лабиринтом Риши и Камино.
5. США
6. Экипировка морпеха и пистолет-пулемет P90.
7. Управление компьютерами, стрельба, рукопашный бой, дипломатия
8. email: the_laughing_man@stargatesg1.com
9. Земля - 1980г.
SW - 11ДЯБ